腸病毒主要經腸胃道（感染後，糞便依然存在病毒達數個月之久）或呼吸道（飛沫、咳嗽或打噴嚏）傳染。

疾管局指出，當孩童出現發燒、喉嚨痛症狀感染生病時，若能請假在家裡隔離休養，就能有效減少病毒散播機會。一旦孩子出現手足口症、咽峽炎等輕症症狀，應立即向學校請假，家長也應請假在家照顧孩子，發現有嗜睡、抽筋、心跳過速等重症跡象，才能立即就醫，提高治療成功率。

腸病毒的預防方法：
1.勤洗手，養成良好的個人衛生習慣
2.均衡飲食、適度運動及充足睡眠，以提昇免疫力。
3.兒童玩具（尤其是帶毛玩具）經常清洗、消毒。
4.注意居家環境的衛生清潔及通風。
5.流行期間，避免出入人潮擁擠，空氣不流通的公共場所。
6.儘量不要與疑似病患接觸，尤其是孕婦、新生兒及幼童。
7.幼童之照顧者或接觸者應特別注意個人衛生。
8.環境消毒重點：對於常接觸物體表面（門把、桌椅、餐桌、樓梯 扶把）、玩具、寢具及書本做重點性消毒。清洗完畢的物體可移至戶外，接受陽光照射。