本院具備核磁共振造影，骨骼同位素掃描等檢查儀器，並可與台大總院合作進行正子掃描，配合有經驗的專科醫師執行電腦斷層導引針刺切片或手術切片，可幫助肌肉骨骼腫瘤病患獲得正確診斷，並制定正確之治療方針。

1.良性骨腫瘤：治療上以腫瘤除術及植骨術(自體骨，骨骼銀行之異體骨，合成骨…等)為原則，必要時施行內固定術以預防或治療病理性骨折。
2.原發性惡性骨腫瘤：與腫瘤專科醫師合作完成詳盡之診斷分期，如有必要可進行術前之輔助化學療法，減少腫瘤擴散機率，降低腫瘤切除困難度。手術進行廣泛性腫瘤切除後視解剖部位、腫瘤大小選擇以大塊異體骨或訂製型人工關節重建與固定。術後具有完善之輔助治療團隊可進行抗癌化學治療及放射線治療。
3.轉移性惡性骨瘤：骨骼轉移為癌症病患常見的問題，常須配合抗蝕骨藥物之使用以避免發生疼痛、病理性骨折、神經壓迫、高血鈣等併發症。本院具備各式最新抗蝕骨藥物，經醫師評估後可依個人狀況選擇最合適的藥物進行治療。另本院具有合格之專科醫師可評估病理性骨折發生之機率，於適當時機提供腫瘤刮除及預防性固定手術。
4.軟組織腫瘤：醫師問診、觸診後配合各式儀器檢查後獲得合理之臆斷，必要時進行切片手術以建立正確診斷。
(1)良性軟組織腫瘤:較常見，可手術切除或觀察治療
(2)惡性軟組織腫瘤：廣泛性切除後配合整形外科進行重建，是病理診斷進行適當之化學(抗癌藥物)治療或局部之放射治療。