新竹臺大醫院病理部下設新竹醫院病理部及生醫醫院病理部，編制包含三大部門：組織病理、細胞病理、分子病理；陣容完整設備齊全，可提供本院及大新竹地區全方位之組織病理、細胞病理與子宮頸抹片，及分子病理診斷業務，包含常規病理檢查，緊急冷凍切片檢查、特殊染色檢查、免疫化學組織染色檢查、免疫螢光染色檢查、細胞蠟塊檢查、分子檢驗等檢查項目，以提供最完整的病理報告，讓病人能到最完善的臨床處理。

人員編制：
新竹醫院病理部：

病理專科醫師：五名
醫檢師：十二名
助理管理師：二名

生醫醫院病理部：

病理專科醫師：兩名
醫檢師：五名
助理管理師：二名